El indicador SCImago Journal Rank (sjr), que mide la calidad de las revistas a nivel internacional, clasifica al Boletín con Q1 en las categorías Archaeology (Arts and Humanities) y Visual Arts and Performing Arts (ambas del área Arts and Humanities), y Archaeology (área Social Sciences), mientras que con Q2 en Anthropology (área Social Sciences).

Por su parte, el Journal Citation Indicator (jci) de WoS también le asigna Q1 en Arts. Además, en todas las categorías en las que alcanza Q1, la revista ocupa el primer lugar del mundo para publicaciones Diamond Open Access indexadas en Scientific Electronic Library Online (SciELO).

Además de los índices Web of Science (WoS) Arts and Humanities Core Collection y Scopus,  el Boletín se encuentra en Directory of Open Access Journals (DOAJ), ERIH PLUS, SciELO-Chile, HAPI, Redalyc, Fuente Académica Plus – Ebsco, The Research Libraries Group (LRG), Anthropological Literature, Art Abstracts – Ebsco, Art Source – Ebsco, International Bibliography of Art, Art Index.

La presencia y el lugar que ocupa la Revista en estos índices manifiestan que el Boletín del Museo Chileno de Arte Precolombino constituye hoy uno de los principales espacios internacionales para la publicación de investigaciones sobre los pueblos originarios de América en los campos reconocidos por estos indicadores.